¬аше окно в мир —јѕ–
 
Ќовости —татьи јвторы —обыти€ ¬акансии Ёнциклопеди€ –екламодател€м
—татьи

7 августа 2012

GPU и OpenACC ускор€ют ведущее приложение геномики дл€ быстрого создани€ жизненно важных лекарств

6-кратное ускорение программы DNADist помогает Roche и другим фармацевтическим компани€м сократить врем€ разработки лекарств

ЎјЌ’ј… Ц 6 августа, 2012Ч NVIDIA сегодн€ объ€вила о том, что новый стандарт программировани€ OpenACC позволил китайским ученым значительно ускорить работу приложени€ по геномике DNADist1, которое используетс€ на ранних стади€х разработки лекарств от таких генетических заболеваний, как синдром ƒауна, гемофили€, муковисцидоз и серповидно-клеточна€ анеми€.

— помощью OpenACC компил€тора от CAPS исследователи из Ўанхайского ”ниверситета ÷з€отун в 16 раз ускорили приложение DNADist в системе на базе графического процессора NVIDIAЃ TeslaЃ, добавив в код приложени€ всего четыре директивы.

—ерповидно-клеточна€ анеми€: здорова€ клетка  - слева, больна€ Ц справа Ќа фото: серповидно-клеточна€ анеми€: здорова€ клетка - слева, больна€ Ц справа.

DNADist, приложение дл€ расчета матриц рассто€ний и изучени€ генетической св€зи между различными видами ƒЌ  во времени, позвол€ет ученым извлекать информацию из последовательностей ƒЌ  при считывании нуклеотидных последовательностей, чтобы лучше пон€ть причины наследственных заболеваний и быстрее найти способы их лечени€. ”скорив работу приложени€ DNADist, ученые смогут изучить больше данных и быстрее получить ценную информацию дл€ поиска более эффективных способов лечени€ болезни.

OpenACC, стандарт программировани€ дл€ параллельных вычислений с помощью директив, позвол€ет миллионам ученых во всем мире направить огромную мощь графических процессоров на свои исследовани€. ѕользователи, как с опытом параллельного программировани€, так и без него, получают очень простой способ ускорени€ своих исследований с помощью знакомых им моделей программировани€.

OpenACC и ускорение на GPU впечатлили компанию Roche

OpenACC обеспечивает революционное ускорение работы приложений при минимальных усили€х исследователей и программистов. — помощью OpenACC Roche, одна из крупнейших фармацевтических компаний мира, получила возможность изучать и разрабатывать более эффективные лекарства быстрее и дешевле.

Уя поражен, как быстро и легко OpenACC раскрыл потенциал GPU в DNADist, нашем ключевом приложении, - отмечает —тив ѕэн (Steve Pan), директор проектов в Roche Pharma Global Informatics. Ц ¬клад GPU в наши разработки бесценен, потому что чем быстрее мы выведем лекарство на рынок (пусть даже на день раньше!), тем больше жизней мы спасемФ.

Уƒл€ извлечени€ значимой информации из огромного количества данных, заключенных в последовательност€х ƒЌ , требуетс€ все больша€ вычислительна€ мощь, - продолжает —умит √упта (Sumit Gupta), старший директор по бизнесу Tesla в NVIDIA. - OpenACC позвол€ет ученым легко и быстро направл€ть огромную производительность графических процессоров на анализ несметного количества генетических данных. Ёто значительно сокращает врем€ на изучение биологических систем и потенциально ведет к разработке более эффективных препаратов следующего поколени€Ф.

¬се больше ученых и инженеров используют компил€торы с поддержкой OpenACC и гибридные системы на базе CPU/GPU дл€ ускорени€ разнообразных приложений, включа€ —јѕ–, автоматизирование управление, обработку изображений, материаловедение, молекул€рную динамику, квантовую химию и многие другие. ¬о многих случа€х пользователи за€вл€ют о 5-10-кратном приросте скорости и даже больше всего за пару часов работы.

¬эбинар по OpenACC, DNADist Ц 6 сент€бр€, 2012

 омпани€ CAPS проведет первый бесплатный публичный вэбинар в четверг 6 сент€бр€ 2012 года, чтобы продемонстрировать область применени€ OpenACC и лучшие примеры его использовани€, а также подробнее рассказать об ускорении приложени€ DNADist. „тобы узнать подробнее о вэбинаре и зарегистрироватьс€, пройдите по ссылке https://www2.gotomeeting.com/register/668751466.

ќ GPU NVIDIA Tesla

GPU NVIDIA Tesla Ц это массивно параллельные ускорители, основанные на платформе параллельных вычислений NVIDIA CUDAЃ. √рафические процессоры Tesla созданы с нул€ дл€ экономичных, высокопроизводительных вычислений, вычислительной науки и супервычислений, обеспечива€ намного более высокую скорость работы широкого круга научных и коммерческих приложений по сравнению с системой на базе CPU. —егодн€ процессоры GPU лежат в основе трех из п€ти самых мощных в мире суперкомпьютеров.

ѕодробнее о GPU NVIDIA Tesla смотрите на странице Tesla. ѕодробнее о CUDA и последнюю версию ѕќ смотрите на странице CUDA. —мотрите новости NVIDIA, информацию о компании и продуктах, видео, изображени€ и другую информацию смотрите в новостном разделе NVIDIA newsroom. —ледите за новост€ми NVIDIA в Twitter (@NVIDIATesla).

ќ компании NVIDIA

NVIDIA (NASDAQ: NVDA) открыла миру мощь компьютерной графики с изобретением GPU в 1999 году. Ќа сегодн€шний день процессоры NVIDIA обеспечивают мощностью большое число продуктов от смартфонов до суперкомпьютеров. ћобильные процессоры NVIDIA используютс€ в сотовых телефонах, планшетах и информационно-развлекательных системах. √еймеры довер€ют GPU, так как они позвол€ют погрузитьс€ в неверо€тные миры. ѕрофессионалы используют их дл€ создани€ визуальных эффектов в кино и проектировани€, начина€ от гольф-клубов и заканчива€ авиалайнерами. »сследователи работают с GPU дл€ расширени€ границ наук при помощи высокопроизводительных вычислений.  омпани€ обладает более 2 200 патентами по всему миру, включа€ те, что легли в основу современных вычислений. ѕодробнее смотрите www.nvidia.ru.

# # #

1) DNADist Ц это часть пакета программ с открытым исходным кодом Phylip (PHYLogeny Inference Package), которые используют ученые в бионауках, и в первую очередь в филогении. »сточник: http://en.wikipedia.org/wiki/PHYLIP

ќтдельные за€влени€ данного пресс-релиза, включа€, но не ограничива€сь ими, упоминающие о вли€нии и преимуществах NVIDIA Tesla GPU; а также о вли€нии патентов компании на современные вычислени€, привод€тс€ с расчетом на будущее и могут измен€тьс€ в результате обсто€тельств и рисков, привод€щих к результатам, материально отличным от ожидаемых. “акие обсто€тельства и риски включают разработку более быстрой или эффективной технологии, использование CPU дл€ параллельных вычислений, конструкторские, производственные или программные ошибки, вли€ние технологического развити€ и конкуренции, изменени€ в предпочтени€х и требовани€х покупателей, выбор других стандартов или продуктов конкурентов покупател€ми, изменени€ в стандартах отрасли и интерфейсах, неожиданное снижение производительности наших продуктов или технологий при интеграции в системы, а также другие риски, указываемые врем€ от времени в отчетах, которые NVIDIA отсылает в  омиссию по ценным бумагам и биржевым операци€м, включа€ отчет по форме 10-Q за финансовый период, закончившийс€ 29 апрел€ 2012 года.  опии отчетов дл€ SEC опубликованы на нашем сайте и доступны у NVIDIA бесплатно. ƒанные, относ€щиес€ к будущему за€влению, не относ€тс€ к будущей производительности, а только к текущему моменту, и, кроме случаев, установленных законом, NVIDIA не несет ответственность за обновление таких за€влений, чтобы отразить будущие событи€ или обсто€тельства.

©  омпани€ NVIDIAЃ, 2012. ¬се права защищены. NVIDIA, логотип NVIDIA, Tesla и CUDA €вл€ютс€ товарными знаками и/или зарегистрированными товарными знаками компании NVIDIA в —Ўј и/или других странах. ¬се другие названи€ компаний и/или продуктов могут €вл€тьс€ товарными знаками и/или зарегистрированными товарными знаками соответствующих владельцев. ‘ункции, цены, наличие и спецификации могут быть изменены без предупреждени€.

ƒобавить комментарий

„итайте также:


¬акансии:

јктуальное обсуждение

RSS-лента комментариев

ƒавид Ћевин
ƒавид Ћевин
ќт редактора: ƒети, роботы, труд, май
ѕроект ЂЌародное —јѕ–-интервьюї

—лучайна€ стать€:

isicad Top 10

—амые попул€рные материалы

   ‘орумы isicad:

isicad-2010 isicad-2008
isicad-2006 isicad-2004

ќ проекте

ѕриглашаем публиковать на сайте isicad.ru новости и пресс-релизы о новых решени€х и продуктах, о проводимых меропри€ти€х и другую информацию. јдрес дл€ корреспонденции - info@isicad.ru

ѕроект isicad нацелен на

  • укрепление контактов между разработчиками, поставщиками и потребител€ми промышленных решений в област€х PLM и ERP...
ѕодробнее

»нформаци€ дл€ рекламодателей


¬се права защищены. © 2004-2022 √руппа компаний «Ћ≈ƒј—»

ѕерепечатка материалов сайта допускаетс€ с согласи€ редакции, ссылка на isicad.ru об€зательна.
¬ы можете обратитьс€ к нам по адресу info@isicad.ru.